160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2922 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 477 aa  983    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  53.33 
 
 		 481 aa  524  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  47.08 
 
 		 484 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  41.71 
 
 		 463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  62.89 
 
 		 198 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 455 aa  173  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 480 aa  170  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  30.21 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 478 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  28.6 
 
 		 467 aa  160  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 508 aa  156  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  33 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  28.54 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 485 aa  129  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  75.68 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  72.5 
 
 		 334 aa  123  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.03 
 
 		 526 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 468 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  26.49 
 
 		 479 aa  110  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 620 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  27.79 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 446 aa  107  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 509 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  26.55 
 
 		 382 aa  103  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  26.78 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  27.08 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  26.18 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  26.44 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 334 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 430 aa  96.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  24.67 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 582 aa  95.1  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 		 500 aa  94.4  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  60 
 
 		 175 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  27.7 
 
 		 454 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  34.65 
 
 		 205 aa  89  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25.41 
 
 		 462 aa  87.8  4e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 582 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  53.01 
 
 		 224 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 235 aa  86.7  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 412 aa  86.7  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  24.08 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.21 
 
 		 561 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 571 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.05 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  55.71 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  24.33 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  24.55 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  26.12 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  31.03 
 
 		 314 aa  76.3  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.49 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 226 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  33.09 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  23.18 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  23.51 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  23.66 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  21.53 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  23.75 
 
 		 538 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  25.72 
 
 		 606 aa  70.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  23.68 
 
 		 560 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 		 568 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  25.05 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 572 aa  70.1  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 		 545 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 687 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  23.67 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 586 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  23.33 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 663 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>