74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0094 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  59.58 
 
 		 568 aa  709    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 572 aa  1181    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 		 560 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  40.49 
 
 		 552 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 554 aa  363  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2241  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 		 441 aa  356  7.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  26.22 
 
 		 538 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 488 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  25.6 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  28.61 
 
 		 478 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  26.15 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 483 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  26.69 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 483 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1286  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 219 aa  94.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  23.32 
 
 		 555 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  22.91 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  22.48 
 
 		 548 aa  79.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  22.43 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  22.69 
 
 		 545 aa  73.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 477 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  22.12 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 582 aa  67  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  22.43 
 
 		 628 aa  62  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.17 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  24.1 
 
 		 606 aa  58.9  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.61 
 
 		 475 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  21.98 
 
 		 374 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  20.88 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  22.9 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  27.27 
 
 		 526 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  20 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 687 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  22.98 
 
 		 456 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  26.94 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 634 aa  52  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  23.08 
 
 		 470 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 619 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 589 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  24.95 
 
 		 448 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  22.63 
 
 		 481 aa  51.2  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 		 586 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.06 
 
 		 561 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  20.71 
 
 		 433 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.24 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 		 412 aa  48.9  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 509 aa  48.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 311 aa  47  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 508 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 		 663 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  29.29 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  26.78 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.56 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 		 459 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 468 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  23.34 
 
 		 494 aa  44.3  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  23 
 
 		 484 aa  44.3  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 485 aa  44.3  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  29.17 
 
 		 205 aa  43.5  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>