127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1512 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  424  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  91.24 
 
 
479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  43.84 
 
 
467 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  40.37 
 
 
462 aa  124  1e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  35.75 
 
 
471 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  31.8 
 
 
480 aa  111  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  36.2 
 
 
276 aa  106  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 
480 aa  104  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 
494 aa  104  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  29.29 
 
 
314 aa  90.5  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 
477 aa  89  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  28 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  31.86 
 
 
322 aa  87.8  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 
508 aa  86.3  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 
484 aa  85.5  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 
478 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 
462 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  32.72 
 
 
485 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 
509 aa  81.6  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  31.77 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 
502 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
556 aa  75.1  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  28.86 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  43.82 
 
 
582 aa  73.2  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  34.92 
 
 
555 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
620 aa  70.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 
582 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 
485 aa  67.8  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 
606 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 
561 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 
469 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0363  divergent AAA ATPase  51.67 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  31.75 
 
 
311 aa  64.3  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 
475 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 
572 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  39.76 
 
 
330 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 
457 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.85 
 
 
336 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  35.2 
 
 
433 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  37.63 
 
 
470 aa  62  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 
522 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 
422 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 
423 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 
571 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  26.36 
 
 
526 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.39 
 
 
334 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  35.11 
 
 
403 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 
403 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 
358 aa  59.3  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.16 
 
 
175 aa  58.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  28.57 
 
 
423 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 
519 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  37.35 
 
 
456 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  30.95 
 
 
453 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 
455 aa  57  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
492 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1108  hypothetical protein  36 
 
 
122 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.617491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 
376 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 
467 aa  55.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  35.42 
 
 
1492 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 
545 aa  55.1  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
472 aa  55.5  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 
427 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2244  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 
82 aa  54.7  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 
589 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  39.68 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 
394 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  28.36 
 
 
483 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 
430 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 
551 aa  52.4  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 
469 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
581 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  28.66 
 
 
456 aa  52  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  35.8 
 
 
548 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
402 aa  51.6  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 
412 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 
459 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 
488 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
412 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 
619 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 
620 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 
620 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 
479 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
446 aa  48.9  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 
483 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 
394 aa  48.5  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 
478 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  24.56 
 
 
423 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 
412 aa  48.5  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  36.36 
 
 
342 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  34.29 
 
 
478 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 
385 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 
299 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 
468 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 
456 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  36.96 
 
 
382 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  29.45 
 
 
634 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>