137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3608 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 628 aa  1273    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  73.02 
 
 		 611 aa  887    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  46.82 
 
 		 634 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  41.96 
 
 		 687 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 641 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 606 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  42.95 
 
 		 619 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 		 622 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 571 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  27.29 
 
 		 582 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 620 aa  121  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 620 aa  121  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  23.21 
 
 		 663 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  26.41 
 
 		 543 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  27.79 
 
 		 433 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.2 
 
 		 475 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 515 aa  110  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 		 643 aa  105  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  28.86 
 
 		 620 aa  101  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 456 aa  99.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  25.46 
 
 		 572 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  23.75 
 
 		 469 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  26.46 
 
 		 455 aa  96.3  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 		 504 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 394 aa  90.5  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 663 aa  90.5  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 		 479 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 		 459 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 509 aa  89  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  28.63 
 
 		 448 aa  87.8  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  26.08 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  27.57 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 394 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  28.3 
 
 		 448 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  24.34 
 
 		 483 aa  77  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  26.76 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  26.46 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  24.42 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  26.04 
 
 		 545 aa  73.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.46 
 
 		 545 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  26.07 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 299 aa  72  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  23.52 
 
 		 572 aa  70.5  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 		 402 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  22.41 
 
 		 555 aa  67.4  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 480 aa  67  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 455 aa  66.6  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  25.65 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.85 
 
 		 526 aa  64.3  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  23.04 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 376 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 374 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  23.87 
 
 		 556 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.12 
 
 		 403 aa  62  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  25.33 
 
 		 581 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 403 aa  62  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  24.27 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  25.6 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 1123 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 		 477 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.63 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  21.99 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  22.61 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  25.87 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  24.85 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  22.61 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  22.85 
 
 		 462 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  26.87 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  23.23 
 
 		 552 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 		 467 aa  55.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 483 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 226 aa  54.3  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>