55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2269 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  70.99 
 
 		 554 aa  806    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  75.55 
 
 		 552 aa  886    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 556 aa  1149    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  47.1 
 
 		 560 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 572 aa  382  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 568 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2241  putative transcriptional regulator  41.26 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  67.42 
 
 		 256 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 538 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  23.74 
 
 		 555 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  24.16 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 564 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  23.39 
 
 		 556 aa  77.8  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  23.28 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  22.67 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  22.22 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  22.22 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.33 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  29.55 
 
 		 470 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  24.08 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  21.22 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  22.7 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  54.24 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  23 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  22.53 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  22.67 
 
 		 561 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 634 aa  55.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 488 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  32.54 
 
 		 376 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 478 aa  53.5  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  20.64 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  23.66 
 
 		 571 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  22.55 
 
 		 446 aa  51.2  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  22.54 
 
 		 582 aa  51.2  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 522 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  25 
 
 		 526 aa  50.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  22.2 
 
 		 611 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  22.44 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  23.18 
 
 		 394 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  20.97 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  21.09 
 
 		 456 aa  47.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  24.1 
 
 		 433 aa  48.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 433 aa  47.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1286  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 219 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 589 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>