125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1961 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 515 aa  1060    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 		 622 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  39.33 
 
 		 543 aa  351  2e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  36.74 
 
 		 504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 643 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 656 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 656 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 		 663 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  29.88 
 
 		 475 aa  192  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 620 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 620 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 460 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  37.05 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 619 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  23.82 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 634 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 572 aa  103  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 611 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 628 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 		 582 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  35.71 
 
 		 167 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.27 
 
 		 687 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 606 aa  100  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0396  putative transcriptional regulator  37.01 
 
 		 167 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00892545  normal  0.277026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0397  putative transcriptional regulator  37.01 
 
 		 167 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 641 aa  97.4  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 		 167 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 		 167 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 		 167 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 602 aa  95.9  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  31.14 
 
 		 167 aa  94.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3244  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 163 aa  94.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3628  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 167 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000786438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 545 aa  93.2  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  30.91 
 
 		 167 aa  93.2  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3577  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 		 167 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0449  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 171 aa  90.5  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  25.87 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  21.61 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  26.69 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  22.85 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  26.93 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  22.1 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  23.91 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  24.59 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  25.55 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  22.91 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.28 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  24.29 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  23.97 
 
 		 620 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  26.59 
 
 		 555 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  21.98 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  23.6 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  25 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  21.82 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  24.71 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  25.19 
 
 		 548 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23.64 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  23.4 
 
 		 538 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  21.38 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  23 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  22.75 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  22.35 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  22.92 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  23.47 
 
 		 522 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  23.47 
 
 		 526 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  25.39 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 469 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  25.2 
 
 		 322 aa  52.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2123  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 157 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  22 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 581 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 663 aa  50.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  25.46 
 
 		 564 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  23.66 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 		 500 aa  50.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  23.81 
 
 		 334 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  25.33 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 427 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  22.44 
 
 		 556 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>