97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1518 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 498 aa  1018    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  42.83 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  44.64 
 
 		 483 aa  326  7e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 485 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 499 aa  296  4e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  42.55 
 
 		 314 aa  193  6e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  43.56 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  24.65 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  23.85 
 
 		 622 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.59 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 643 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  23.28 
 
 		 504 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  23.84 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.47 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  28.51 
 
 		 634 aa  83.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  26.69 
 
 		 515 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  26.91 
 
 		 687 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 663 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  25.44 
 
 		 548 aa  73.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  23.74 
 
 		 545 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  23 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  24.48 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23.65 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 656 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 656 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  24.45 
 
 		 543 aa  66.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  23.51 
 
 		 448 aa  66.6  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  21.6 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  32.62 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  23.38 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  23.21 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 394 aa  62  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 		 611 aa  62  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  22.88 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  22.11 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  24.81 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  19.86 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  23.97 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  23.46 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  24.46 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  21.43 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 412 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 620 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 620 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  25 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  22.22 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 		 641 aa  55.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 480 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 561 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 		 383 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  20.5 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  42.62 
 
 		 756 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 		 208 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 160 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1442  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 179 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  22.38 
 
 		 402 aa  51.2  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 		 138 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  45.76 
 
 		 218 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  22.87 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 385 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 412 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 427 aa  47  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 		 226 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1151  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 163 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.796033  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.18 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.18 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  23.27 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 508 aa  45.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  23.49 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  28.69 
 
 		 199 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  23.31 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  22.94 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 572 aa  43.9  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 545 aa  43.5  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  22.67 
 
 		 377 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  22.95 
 
 		 463 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>