91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0027 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  932    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  30.8 
 
 
457 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 
467 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 
448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 
448 aa  139  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 
433 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  26.29 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  22.98 
 
 
469 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  28.39 
 
 
455 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.34 
 
 
463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.72 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 
383 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  27.79 
 
 
477 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  26.43 
 
 
462 aa  103  7e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25 
 
 
456 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 
469 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 
494 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.08 
 
 
334 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 
484 aa  97.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 
481 aa  90.5  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  24.66 
 
 
311 aa  88.2  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  23.5 
 
 
455 aa  87  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  22.82 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  19.58 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  21.41 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  22.65 
 
 
485 aa  83.2  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 
480 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  20.33 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  21.88 
 
 
502 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 
508 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.01 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  22.85 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  22.66 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  20.79 
 
 
456 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  22.95 
 
 
522 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  22.25 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  22.16 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  21.05 
 
 
620 aa  71.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  22.63 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  23.77 
 
 
526 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  23.08 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  23.96 
 
 
479 aa  69.7  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.34 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  22.55 
 
 
500 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  20.8 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  19.95 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.25 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  24.5 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.65 
 
 
475 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  22.14 
 
 
462 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  22.37 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  21.28 
 
 
634 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  20.7 
 
 
606 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  23.06 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  22.54 
 
 
403 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  22.54 
 
 
403 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  23.29 
 
 
611 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  22.34 
 
 
475 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  21.45 
 
 
456 aa  57.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  22.93 
 
 
551 aa  56.6  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  22.83 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  20.91 
 
 
548 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  20.22 
 
 
545 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  21.32 
 
 
582 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  22.61 
 
 
545 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  20.5 
 
 
498 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  22.16 
 
 
581 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  17.99 
 
 
602 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  20.44 
 
 
555 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2123  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 
157 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  20.51 
 
 
448 aa  50.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  21.35 
 
 
499 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  30.97 
 
 
198 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  21.37 
 
 
687 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  21.98 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 
641 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 
572 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  20.72 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  23.96 
 
 
582 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  22.98 
 
 
619 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  20.2 
 
 
556 aa  47  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  20.97 
 
 
628 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  20.05 
 
 
538 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  21.6 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  24.11 
 
 
485 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  26.88 
 
 
235 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  20.78 
 
 
515 aa  44.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  21.08 
 
 
483 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>