171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2782 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 471 aa  967    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  61.73 
 
 		 480 aa  595  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  61.68 
 
 		 480 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  41.56 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  44.72 
 
 		 485 aa  330  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  30.15 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  37.32 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 448 aa  154  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 433 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  29.83 
 
 		 403 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 		 403 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.53 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  30.08 
 
 		 382 aa  141  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  25.05 
 
 		 478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 508 aa  140  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 		 448 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 620 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  26.64 
 
 		 479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  30.79 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 374 aa  127  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 235 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  27.99 
 
 		 545 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 456 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25.59 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  30.19 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 376 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 		 462 aa  117  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  35.75 
 
 		 205 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  31.27 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 423 aa  114  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  28.19 
 
 		 555 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  35.68 
 
 		 198 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  27.58 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  32.57 
 
 		 276 aa  110  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  27.6 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 457 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  28.16 
 
 		 389 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  25.84 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 475 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 472 aa  103  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 663 aa  100  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 561 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 538 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 		 545 aa  98.2  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 394 aa  97.1  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  24.42 
 
 		 394 aa  96.7  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  26.14 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 572 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.47 
 
 		 412 aa  95.1  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  27 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  38.17 
 
 		 226 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 299 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.65 
 
 		 463 aa  90.5  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  28.31 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  26.03 
 
 		 442 aa  87.8  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  24.24 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1108  hypothetical protein  39.09 
 
 		 122 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.617491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 581 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  32.16 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  24.19 
 
 		 606 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  26.45 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  31.63 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  23.8 
 
 		 548 aa  81.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 571 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.93 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  23.38 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 634 aa  77.4  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>