178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1706 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  97.08 
 
 		 480 aa  956    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 480 aa  987    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  61.68 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  41.47 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 485 aa  329  8e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 		 455 aa  239  6.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 448 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 468 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  29.56 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  30.28 
 
 		 382 aa  143  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 391 aa  143  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  32.55 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  28.47 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  28.47 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  27.92 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 478 aa  139  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 620 aa  137  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  32.19 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 479 aa  133  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  28.53 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  26.16 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 		 402 aa  120  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  30.4 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  28.53 
 
 		 423 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  28.27 
 
 		 555 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  27.71 
 
 		 423 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25.2 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  33.76 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  28.2 
 
 		 376 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  26.02 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 475 aa  106  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  30.88 
 
 		 205 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  28.82 
 
 		 545 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 522 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  28.01 
 
 		 519 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  33.33 
 
 		 198 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 394 aa  103  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 509 aa  103  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.83 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  38.52 
 
 		 226 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 299 aa  101  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  27.79 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 413 aa  100  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  26.02 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  27.37 
 
 		 483 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  26.46 
 
 		 1123 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  30.21 
 
 		 235 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  27.76 
 
 		 606 aa  93.6  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  21.81 
 
 		 462 aa  93.2  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 383 aa  93.2  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 687 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 		 463 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 		 572 aa  93.2  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 663 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 561 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  27.32 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 		 545 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 		 538 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 		 556 aa  87.8  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  24.07 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 		 581 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  23.19 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.4 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  22.27 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  31.56 
 
 		 582 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  29.96 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>