113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0893 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  100 
 
 
358 aa  733    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 
433 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  31.91 
 
 
311 aa  100  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  32.6 
 
 
453 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  32.42 
 
 
442 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 
480 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 
462 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 
480 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  36.21 
 
 
462 aa  76.3  0.0000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  31.97 
 
 
471 aa  73.2  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  35.1 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 
620 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 
545 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  31.51 
 
 
494 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 
663 aa  69.3  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 
454 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 
538 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  29.3 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 
456 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
412 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 
582 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 
485 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 
467 aa  67  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  34.4 
 
 
1492 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  29.38 
 
 
479 aa  66.2  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 
556 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  38.74 
 
 
548 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 
561 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 
477 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 
448 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 
478 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  34.45 
 
 
483 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
459 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  31.08 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  40 
 
 
555 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 
235 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 
479 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 
469 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  37.62 
 
 
581 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 
396 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 
391 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 
446 aa  62.4  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  26.9 
 
 
589 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 
467 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 
413 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  33.33 
 
 
483 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  30.56 
 
 
456 aa  60.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 
483 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  36.56 
 
 
205 aa  59.7  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
472 aa  59.3  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  34.13 
 
 
572 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  31.58 
 
 
470 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 
455 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 
571 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 
427 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  35.35 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 
586 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 
582 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 
522 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.75 
 
 
526 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  33.33 
 
 
634 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.3 
 
 
582 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 
502 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 
433 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  33.66 
 
 
448 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3059  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 
599 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 
551 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 
500 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  34.41 
 
 
198 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  27.05 
 
 
475 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 
457 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 
394 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 
564 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 
483 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 
394 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  32.54 
 
 
376 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 
519 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 
463 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 
460 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.43 
 
 
389 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 
606 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 
628 aa  49.7  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 
455 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  25.71 
 
 
484 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>