147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2603 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  100 
 
 
469 aa  963    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  48.85 
 
 
467 aa  332  6e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  30.45 
 
 
463 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
412 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  34.87 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 
477 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 
481 aa  150  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  30 
 
 
457 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 
433 aa  143  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  33.76 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  30.63 
 
 
456 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 
455 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  23.57 
 
 
462 aa  127  5e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 
455 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 
478 aa  124  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 
446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25.76 
 
 
462 aa  121  3e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 
484 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  30.5 
 
 
548 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 
545 aa  110  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 
430 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 
383 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 
471 aa  107  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 
480 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 
480 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 
334 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 
396 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 
468 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  34.29 
 
 
526 aa  96.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  33.46 
 
 
522 aa  96.7  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  26.76 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  36 
 
 
502 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.47 
 
 
403 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 
403 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  34.27 
 
 
508 aa  93.2  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 
433 aa  93.2  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.73 
 
 
634 aa  91.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  24.95 
 
 
454 aa  91.3  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  26.51 
 
 
311 aa  90.5  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 
467 aa  90.1  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 
494 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  33.95 
 
 
500 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 
620 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  29.36 
 
 
459 aa  86.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 
479 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  25.73 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  27.58 
 
 
561 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  27.98 
 
 
276 aa  79.7  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  29.82 
 
 
1492 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.63 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  24.51 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  22.9 
 
 
492 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  25.39 
 
 
606 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  23.57 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  24.74 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 
582 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 
571 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  39.64 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  26.29 
 
 
556 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  22.34 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 
628 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  25.12 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 
551 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 
641 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.86 
 
 
687 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 
582 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1878  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 
136 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.97421  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  24.69 
 
 
456 aa  68.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  25.99 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25 
 
 
391 aa  67  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  25.58 
 
 
470 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 
581 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  27.96 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 
564 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 
572 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  36.43 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 
611 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 
488 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 
358 aa  63.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  21.62 
 
 
475 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 
619 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 
235 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 
422 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 
462 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 
586 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>