182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1244 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  100 
 
 
455 aa  919    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  49.88 
 
 
433 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  39.91 
 
 
448 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  38.34 
 
 
448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  38.15 
 
 
478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  44.47 
 
 
446 aa  302  7.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  97.87 
 
 
189 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
456 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 
383 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 
467 aa  209  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  32.19 
 
 
500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 
477 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 
334 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  29.26 
 
 
463 aa  160  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 
485 aa  157  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 
456 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  29.56 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  28.63 
 
 
468 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 
479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 
412 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 
484 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  33.48 
 
 
526 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 
522 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 
457 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  32.96 
 
 
508 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 
469 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 
481 aa  136  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 
433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 
455 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 
502 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  23.85 
 
 
582 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 
561 aa  123  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  26.9 
 
 
571 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  28.39 
 
 
462 aa  120  7e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  28.61 
 
 
385 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 
494 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  25 
 
 
548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.47 
 
 
634 aa  113  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 
620 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  23 
 
 
545 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 
226 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  26.22 
 
 
462 aa  102  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 
376 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 
581 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.34 
 
 
403 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 
403 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 
299 aa  97.1  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 
619 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  26.46 
 
 
394 aa  94.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  25.42 
 
 
555 aa  94  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  26.99 
 
 
611 aa  93.2  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 
538 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  22.96 
 
 
478 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  22.86 
 
 
478 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 
391 aa  90.1  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  22.51 
 
 
423 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  24.86 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 
402 aa  87.4  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  21.12 
 
 
572 aa  87.4  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  22.07 
 
 
456 aa  87.4  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 
556 aa  87  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.71 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  25.54 
 
 
687 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  23.46 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25.59 
 
 
402 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  26 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.63 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 
1123 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 
663 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  27.57 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 
606 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 
622 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  23.04 
 
 
545 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  24.34 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  25.96 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  22.91 
 
 
572 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 
374 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 
499 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.18 
 
 
467 aa  77  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  21.8 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  23.92 
 
 
1492 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  34.35 
 
 
138 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  23.22 
 
 
551 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  26.29 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0666  putative transcriptional regulator  41 
 
 
110 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0430464  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  23.5 
 
 
485 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  24.66 
 
 
470 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  23.76 
 
 
453 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  23.65 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>