28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0666 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0666  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0430464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  37.96 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  41 
 
 		 455 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 448 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 456 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 		 500 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 448 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 459 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 468 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 502 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  38.1 
 
 		 376 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.28 
 
 		 372 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.28 
 
 		 372 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 479 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3965  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 		 213 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.101474  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  35.82 
 
 		 384 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3995  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 658 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.77 
 
 		 365 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.68 
 
 		 368 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.68 
 
 		 371 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.65 
 
 		 373 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.94 
 
 		 373 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  36.23 
 
 		 348 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  36.23 
 
 		 348 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  42.31 
 
 		 252 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2039  Sigma 54 interacting domain protein  40.62 
 
 		 840 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.84 
 
 		 374 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>