172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1210 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  75.89 
 
 
448 aa  700    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  100 
 
 
448 aa  899    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  46.59 
 
 
433 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  38.34 
 
 
455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 
456 aa  281  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  35.67 
 
 
467 aa  216  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 
446 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  36.22 
 
 
334 aa  189  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  34.77 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 
455 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 
469 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  32.57 
 
 
463 aa  177  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  33.89 
 
 
468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 
479 aa  170  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  32.33 
 
 
456 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  33.65 
 
 
500 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 
383 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 
485 aa  156  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 
430 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 
508 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 
522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  36.63 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  27.19 
 
 
457 aa  143  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  33.76 
 
 
469 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 
471 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  25.26 
 
 
462 aa  139  1e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  28.54 
 
 
477 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  33.6 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  27.98 
 
 
433 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  28.61 
 
 
412 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  30 
 
 
480 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 
494 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  50 
 
 
189 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 
620 aa  117  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 
386 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  30.27 
 
 
396 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  31.92 
 
 
226 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 
571 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  29.18 
 
 
545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  28.87 
 
 
687 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 
454 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 
403 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  28.82 
 
 
376 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  30.08 
 
 
403 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  28.82 
 
 
548 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  23.56 
 
 
462 aa  107  5e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 
484 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  28.42 
 
 
311 aa  103  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  29.74 
 
 
422 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 
412 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  27.79 
 
 
555 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 
606 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 
581 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  28.32 
 
 
413 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  26.86 
 
 
423 aa  100  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  27.27 
 
 
634 aa  100  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 
538 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 
556 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  26.44 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  26.91 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 
622 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  28 
 
 
299 aa  92.8  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 
611 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 
619 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  28.01 
 
 
394 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  27.53 
 
 
394 aa  90.1  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 
641 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 
582 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 
412 aa  87  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 
467 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 
551 aa  83.2  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  38.89 
 
 
198 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 
582 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  26.07 
 
 
442 aa  83.2  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 
572 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 
462 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.87 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  27.73 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 
472 aa  80.1  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  26.15 
 
 
448 aa  80.1  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.48 
 
 
475 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  23.31 
 
 
473 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 
586 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  22.27 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 
564 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  27.1 
 
 
479 aa  73.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 
235 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 
628 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 
483 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  29.24 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>