137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2458 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 619 aa  1278    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  46.21 
 
 		 634 aa  531  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  41.99 
 
 		 611 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  42.95 
 
 		 628 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  40.69 
 
 		 606 aa  439  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  40.03 
 
 		 641 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  41.99 
 
 		 687 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 582 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 		 571 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  25.35 
 
 		 622 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  28.17 
 
 		 475 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  25.61 
 
 		 572 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 		 433 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  23.08 
 
 		 663 aa  120  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 		 448 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  23.11 
 
 		 620 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  23.11 
 
 		 620 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 656 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 656 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  24.71 
 
 		 543 aa  111  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 504 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  25.05 
 
 		 455 aa  103  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 386 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25.88 
 
 		 456 aa  94.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 478 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 		 448 aa  92.8  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  25.44 
 
 		 643 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  25.06 
 
 		 478 aa  90.9  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  25.32 
 
 		 548 aa  87.8  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.06 
 
 		 485 aa  87  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  28.51 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  26.08 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 582 aa  83.6  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 394 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  23.47 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  25.92 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  24.18 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 663 aa  76.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 545 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  29.96 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  23.22 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 455 aa  73.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  20.5 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  27.01 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  26.4 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 620 aa  70.5  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 502 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  24.28 
 
 		 602 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.33 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.19 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.2 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.86 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  23.15 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 545 aa  63.9  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  23.15 
 
 		 385 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 		 226 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  25.11 
 
 		 538 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 484 aa  62  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  22.55 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  31.93 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  22.94 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  23.21 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  22.31 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  22.74 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  27.56 
 
 		 555 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  26.36 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  23.1 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  23.16 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  25 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  23.18 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.42 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  23.74 
 
 		 483 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 189 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  22.81 
 
 		 1123 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>