128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0066 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  907    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  51.09 
 
 		 462 aa  362  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  50.27 
 
 		 475 aa  359  7e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 433 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  36.46 
 
 		 276 aa  106  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  24.21 
 
 		 453 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.11 
 
 		 475 aa  103  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 		 469 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 620 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 454 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  24.49 
 
 		 462 aa  90.1  8e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 494 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  23.73 
 
 		 446 aa  87.8  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  25.88 
 
 		 457 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  26.07 
 
 		 448 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  33.53 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.41 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  24.86 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  22.58 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  22.29 
 
 		 564 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.16 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  24.6 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  24.39 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  24.39 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  24.57 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  22.37 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  22.98 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  24.34 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  21.57 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  22.39 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  22.02 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 582 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 		 586 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  30.05 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.45 
 
 		 687 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.73 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  21.52 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  31.69 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  22.58 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  22.78 
 
 		 481 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  21.87 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  23 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  21.77 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 538 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  36.76 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  36.08 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0608  DNA-binding protein, putative  47.92 
 
 		 57 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.581631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  31.79 
 
 		 561 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 551 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  35.16 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  22.05 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  37.1 
 
 		 328 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  21.23 
 
 		 423 aa  53.9  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  22.55 
 
 		 620 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  22.55 
 
 		 620 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  28.27 
 
 		 571 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2123  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 157 aa  53.1  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 641 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 663 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  22.02 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 		 138 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  23.08 
 
 		 555 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 313 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1492 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  22.77 
 
 		 606 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 589 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  22.71 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  20.42 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>