28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5330 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  44.19 
 
 
277 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  43.2 
 
 
756 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  35.93 
 
 
705 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  28.86 
 
 
492 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  36.31 
 
 
778 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  36.27 
 
 
764 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  33.93 
 
 
382 aa  99.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 
632 aa  89  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 
489 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  31.52 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  38.37 
 
 
412 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 
390 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  31.07 
 
 
442 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 
218 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  40 
 
 
430 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 
469 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 
223 aa  45.8  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 
463 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 
499 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 
160 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 
561 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  31.01 
 
 
207 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 
433 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  30 
 
 
225 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 
222 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 
138 aa  42.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>