99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2841 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 458 aa  942    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  42.83 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  43.96 
 
 		 483 aa  336  5e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  43.98 
 
 		 499 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 485 aa  322  7e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  50 
 
 		 322 aa  225  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  51.43 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 622 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  23.8 
 
 		 643 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 545 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.65 
 
 		 475 aa  87.4  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 687 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  25.8 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  24.2 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  23 
 
 		 548 aa  80.1  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 656 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  25.84 
 
 		 611 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 656 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  23.2 
 
 		 555 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  23.06 
 
 		 663 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  23.46 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  22.25 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 634 aa  70.1  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  22.34 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1442  putative transcriptional regulator  34.51 
 
 		 179 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  22.1 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  23.4 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  23.32 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.77 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1151  putative transcriptional regulator  53.7 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.796033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  23.65 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  24.82 
 
 		 606 aa  60.1  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  21.88 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  21.66 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.02 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  23.28 
 
 		 494 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  21.24 
 
 		 391 aa  57  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  22.28 
 
 		 470 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  20.21 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  23.71 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  21.45 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  22.66 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  22.05 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 620 aa  53.9  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 620 aa  53.9  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  23.11 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.1 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  20.91 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  21.4 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  22.91 
 
 		 586 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  23.79 
 
 		 663 aa  50.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  22.09 
 
 		 455 aa  50.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  22.96 
 
 		 479 aa  50.1  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 167 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  23.1 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 		 208 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 		 167 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  21.28 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 		 167 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 		 167 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  23.51 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  18.89 
 
 		 459 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2925  divergent AAA-4 ATPase related protein  35.25 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  26.72 
 
 		 207 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 		 620 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1666  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  32.1 
 
 		 756 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  29.29 
 
 		 167 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 230 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  25.47 
 
 		 241 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  21.14 
 
 		 377 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  24.4 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  36.23 
 
 		 778 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  21.14 
 
 		 377 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  21.89 
 
 		 581 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  26.12 
 
 		 488 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  29.66 
 
 		 167 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  28.78 
 
 		 167 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  26.72 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  22.07 
 
 		 463 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 218 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  27.64 
 
 		 356 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  22.98 
 
 		 374 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  22.36 
 
 		 572 aa  43.5  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  20.29 
 
 		 467 aa  43.5  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 564 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 396 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>