73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5660 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 643 aa  1308    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  42.05 
 
 		 663 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  41.83 
 
 		 656 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  41.83 
 
 		 656 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  40.6 
 
 		 622 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  50.12 
 
 		 504 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 515 aa  276  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  31.29 
 
 		 543 aa  259  8e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  30.97 
 
 		 460 aa  228  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 459 aa  173  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.69 
 
 		 687 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 620 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 620 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.92 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  27.29 
 
 		 634 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  43.97 
 
 		 167 aa  120  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  43.26 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3244  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 163 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3577  putative transcriptional regulator  42.96 
 
 		 167 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535476  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 485 aa  115  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0449  putative transcriptional regulator  43.97 
 
 		 171 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  22.83 
 
 		 606 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 		 167 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 		 167 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 		 167 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0397  putative transcriptional regulator  39.86 
 
 		 167 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  39.86 
 
 		 167 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3628  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 		 167 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000786438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0396  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 		 167 aa  106  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00892545  normal  0.277026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  23.64 
 
 		 611 aa  104  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  23.8 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 		 641 aa  99  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 498 aa  91.7  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  24.61 
 
 		 483 aa  91.3  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 433 aa  90.5  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  27.4 
 
 		 582 aa  87.8  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  23.42 
 
 		 628 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  23.54 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 619 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  23.26 
 
 		 571 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 556 aa  72.8  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  28.1 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  23.99 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  22.95 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  25.61 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25.29 
 
 		 396 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 386 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  23.37 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  24.28 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  25.47 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  23.41 
 
 		 478 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24.49 
 
 		 455 aa  55.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 456 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  24.2 
 
 		 586 aa  55.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  22.11 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  23.44 
 
 		 555 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  24.28 
 
 		 620 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 508 aa  49.7  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 		 235 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.25 
 
 		 382 aa  48.5  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  22.77 
 
 		 448 aa  48.1  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  25.35 
 
 		 485 aa  48.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.08 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  30.21 
 
 		 442 aa  45.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  22.63 
 
 		 433 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  23.21 
 
 		 226 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  22.33 
 
 		 581 aa  44.3  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2241  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 441 aa  43.9  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>