131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01810 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  100 
 
 		 456 aa  908    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 561 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  26.71 
 
 		 472 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  25.72 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  29.92 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  29.92 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  29.33 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 582 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  28.27 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  30.64 
 
 		 423 aa  96.3  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  28.94 
 
 		 545 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  28.07 
 
 		 586 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 385 aa  90.9  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  22.98 
 
 		 430 aa  90.1  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  27.35 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0136  transcription regulator  32.3 
 
 		 170 aa  87  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0628959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  22.07 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  23.15 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 571 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 545 aa  83.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.18 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 634 aa  82.8  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  25.87 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  23.63 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  26.82 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.13 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  28.53 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  22.8 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  27.09 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  38.05 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  23.09 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  26.76 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  23.88 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  29.48 
 
 		 606 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  26.27 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  23.65 
 
 		 620 aa  73.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 		 572 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  26.16 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 663 aa  70.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  22.49 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 581 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.75 
 
 		 687 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  25.59 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  25.37 
 
 		 555 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 311 aa  66.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 602 aa  63.9  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  21.74 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  22.05 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  22.48 
 
 		 1123 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  27.46 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  33.06 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  22.55 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  26.76 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  37.35 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  21.45 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  26.26 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  23.51 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>