165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1399 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 494 aa  1011    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  41.56 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  41.47 
 
 		 480 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  41.05 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  37.34 
 
 		 485 aa  306  6e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  36.29 
 
 		 455 aa  233  9e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 433 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  28.16 
 
 		 620 aa  150  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  27.82 
 
 		 479 aa  143  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  26.77 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 481 aa  139  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 467 aa  137  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  29.24 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 508 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 448 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  28.57 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  28.2 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  28.91 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 522 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  29.75 
 
 		 526 aa  125  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  27.01 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  30.79 
 
 		 423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  29.18 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  24.95 
 
 		 519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 		 472 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 		 478 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25.44 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  25.59 
 
 		 459 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 433 aa  113  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 454 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 545 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 		 663 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  35.65 
 
 		 205 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 		 499 aa  104  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 311 aa  103  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25.05 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.91 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 383 aa  100  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 		 374 aa  99.8  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  23.43 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  31.58 
 
 		 276 aa  97.1  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  26.29 
 
 		 389 aa  97.1  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  27.48 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 394 aa  94.4  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 571 aa  94  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 687 aa  93.2  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 		 538 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  25.98 
 
 		 586 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 545 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 453 aa  90.5  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  26.42 
 
 		 555 aa  88.6  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  27.47 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 634 aa  87.8  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  24.27 
 
 		 581 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 299 aa  87.4  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 		 235 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  38.29 
 
 		 500 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  24.84 
 
 		 582 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  33.1 
 
 		 226 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  25.66 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.4 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  23.78 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 602 aa  81.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.34 
 
 		 561 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  26.18 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 606 aa  79.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  30.62 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  37.07 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>