153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2855 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 572 aa  1127    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  42.4 
 
 		 582 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  35.2 
 
 		 571 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  40.76 
 
 		 478 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  36.72 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 602 aa  163  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  28.6 
 
 		 606 aa  154  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 634 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  25.1 
 
 		 687 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 611 aa  124  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 620 aa  124  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 423 aa  123  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 456 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 423 aa  118  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 641 aa  117  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 619 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 515 aa  113  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.43 
 
 		 433 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.54 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  29.34 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  22.86 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  31.12 
 
 		 423 aa  108  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 385 aa  104  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 		 402 aa  103  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  27.37 
 
 		 382 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 386 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 622 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  25.7 
 
 		 471 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  22.87 
 
 		 561 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  26.82 
 
 		 480 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.69 
 
 		 475 aa  96.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 413 aa  96.3  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  24.81 
 
 		 462 aa  96.7  1e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 448 aa  93.6  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  22.55 
 
 		 455 aa  93.6  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 412 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 391 aa  92.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.79 
 
 		 334 aa  92.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  26.58 
 
 		 620 aa  92  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  26.58 
 
 		 620 aa  92  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 		 454 aa  90.5  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  28.01 
 
 		 504 aa  90.1  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 582 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  25.44 
 
 		 494 aa  87.8  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 		 456 aa  87  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  24.14 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  24.42 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  23.35 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  26.41 
 
 		 299 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 376 aa  83.2  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.82 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  24.63 
 
 		 628 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  25.91 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 		 389 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  22.86 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.57 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  23.02 
 
 		 481 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 226 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  28.85 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 		 467 aa  73.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 		 663 aa  73.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  26.52 
 
 		 543 aa  73.6  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 		 643 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  26.77 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  26.77 
 
 		 526 aa  70.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 656 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  22.81 
 
 		 656 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  23.75 
 
 		 394 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  23.68 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  26.39 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 545 aa  68.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 235 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  23.22 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  23.92 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  37.11 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  22.76 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>