150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0166 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 412 aa  837    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  73.17 
 
 		 413 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  57.52 
 
 		 412 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  40.6 
 
 		 403 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  40.6 
 
 		 403 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  29.66 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  28.01 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 480 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 471 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  28.25 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 		 620 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.6 
 
 		 433 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  26.28 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 433 aa  96.3  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 422 aa  96.3  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 479 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  26.16 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  24.25 
 
 		 394 aa  93.2  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 485 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 494 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 448 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 571 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  34.88 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  27.3 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  26.75 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  27.57 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  23.1 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.22 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  22.8 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  24.16 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  24.63 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  23.72 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  25.36 
 
 		 484 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  24.65 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  22.95 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  25.93 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 502 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.92 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  26.43 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  31.2 
 
 		 207 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 556 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  22.6 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.08 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 687 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  24.41 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 581 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  21.88 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 545 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  21.43 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  31.82 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  22.72 
 
 		 1123 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3980  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00414076  normal  0.398554 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  25.77 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  33.63 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  30.87 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  22.54 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 		 226 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  23.2 
 
 		 545 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  22.25 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 538 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>