62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3980 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3980  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00414076  normal  0.398554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  58.49 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  43.78 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  35.44 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 208 aa  98.2  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  31.77 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 413 aa  79.3  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 412 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  30.05 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  30.99 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  38.39 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  39.05 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 396 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  33.6 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  28.12 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  41.56 
 
 		 382 aa  57  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  32.04 
 
 		 462 aa  53.1  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 		 433 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 454 aa  52  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 430 aa  52  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 469 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 390 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  28.83 
 
 		 489 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  31.29 
 
 		 480 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 412 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 561 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 480 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 		 485 aa  49.7  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 374 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  44.07 
 
 		 485 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  33 
 
 		 555 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  30.58 
 
 		 467 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 477 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  40.54 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 499 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  29.92 
 
 		 479 aa  46.2  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 463 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  32 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 538 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2925  divergent AAA-4 ATPase related protein  30.83 
 
 		 407 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 385 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  31.88 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  24.24 
 
 		 492 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  32.61 
 
 		 442 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 455 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  31.2 
 
 		 377 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  34.23 
 
 		 483 aa  42.4  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 551 aa  42  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 556 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 		 468 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 632 aa  41.6  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>