119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3604 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 422 aa  853    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  73.49 
 
 		 423 aa  625  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  67.46 
 
 		 423 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  61.61 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  33.42 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  33.42 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  31.12 
 
 		 572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  29.35 
 
 		 382 aa  127  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  28.53 
 
 		 480 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 494 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 480 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  29.54 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  28.61 
 
 		 391 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  31.74 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 582 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  31.69 
 
 		 459 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  29.74 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  28.07 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 620 aa  99  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 		 485 aa  96.3  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  24.83 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 334 aa  94.4  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 492 aa  94.4  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.45 
 
 		 433 aa  93.2  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  24.81 
 
 		 479 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 538 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0766  hypothetical protein  53.49 
 
 		 85 aa  87.8  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 545 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23.46 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 		 571 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  28.64 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  24.48 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.4 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  30.3 
 
 		 526 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  28.51 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  26.16 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  26.06 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.66 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  24.21 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 502 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  22.28 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 473 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  26.18 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  28.84 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25.84 
 
 		 456 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  29.5 
 
 		 276 aa  67  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 		 606 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  28.63 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.51 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.81 
 
 		 687 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  26.04 
 
 		 556 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  24.9 
 
 		 1123 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  28.03 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  21.32 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  23.3 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  30 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  22.65 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 519 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 582 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 581 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 		 663 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  30.65 
 
 		 756 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  35.42 
 
 		 230 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  24.19 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>