80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3033 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  63.14 
 
 		 764 aa  980    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1547    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  49.66 
 
 		 584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  48.98 
 
 		 589 aa  562  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  30.77 
 
 		 596 aa  263  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  28.78 
 
 		 603 aa  259  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  24.88 
 
 		 778 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  26.13 
 
 		 575 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  32.28 
 
 		 705 aa  144  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  43.2 
 
 		 313 aa  138  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  26.83 
 
 		 760 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  26 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  25.61 
 
 		 753 aa  126  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  26.38 
 
 		 570 aa  124  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  25.87 
 
 		 754 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  25.87 
 
 		 754 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  25.2 
 
 		 657 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  32.93 
 
 		 492 aa  105  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  41.26 
 
 		 277 aa  102  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  31.95 
 
 		 632 aa  98.2  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  30.71 
 
 		 592 aa  96.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  26.37 
 
 		 615 aa  91.3  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  25.55 
 
 		 555 aa  90.5  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  32.47 
 
 		 382 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  29.25 
 
 		 617 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  23.13 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  22.6 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  27.95 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  23.64 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  31.94 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  22.64 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  27.2 
 
 		 608 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  22.13 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  23.21 
 
 		 588 aa  74.7  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  24.52 
 
 		 635 aa  73.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  26.25 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  21.97 
 
 		 641 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  26.82 
 
 		 599 aa  71.6  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  30 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  24.18 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  20.22 
 
 		 563 aa  62  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  26.88 
 
 		 690 aa  60.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  24.45 
 
 		 221 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  24.45 
 
 		 221 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  59.7  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  33.93 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  42.19 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  32.73 
 
 		 751 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  32.41 
 
 		 581 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.83 
 
 		 433 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  26.37 
 
 		 402 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  36.21 
 
 		 548 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 422 aa  52.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  42.62 
 
 		 498 aa  52.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  27.95 
 
 		 484 aa  51.6  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  32 
 
 		 423 aa  51.2  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 		 499 aa  50.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 412 aa  50.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  31.46 
 
 		 470 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  32.29 
 
 		 137 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3970  hypothetical protein  29.17 
 
 		 536 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00762799  normal  0.606587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  29.93 
 
 		 391 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  32.1 
 
 		 458 aa  46.2  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 209 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 		 478 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4368  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 255 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  45.8  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 423 aa  44.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 230 aa  44.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 545 aa  44.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  33.67 
 
 		 366 aa  44.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  23.01 
 
 		 697 aa  44.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  23.01 
 
 		 697 aa  44.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  32.29 
 
 		 483 aa  44.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 		 423 aa  44.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.43 
 
 		 699 aa  44.3  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 463 aa  43.9  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>