159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0637 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  100 
 
 
456 aa  925    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  52.63 
 
 
334 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  39.37 
 
 
433 aa  325  9e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
455 aa  283  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  38.22 
 
 
448 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 
448 aa  281  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 
455 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 
446 aa  171  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 
478 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 
500 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 
383 aa  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  29.56 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  30.63 
 
 
469 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 
468 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 
463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  29.16 
 
 
456 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  31.12 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 
479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 
480 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 
469 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  29.67 
 
 
526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 
481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 
494 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  27.9 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 
412 aa  117  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 
508 aa  117  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 
433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.53 
 
 
386 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.52 
 
 
502 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 
545 aa  110  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  28.9 
 
 
470 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  28.01 
 
 
385 aa  103  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 
582 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  25 
 
 
462 aa  103  9e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  39.84 
 
 
189 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  25.72 
 
 
376 aa  99  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 
571 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 
412 aa  97.8  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 
484 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  24.85 
 
 
475 aa  97.1  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.64 
 
 
634 aa  96.3  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 
620 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 
581 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 
472 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 
538 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  29.56 
 
 
394 aa  94.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  26.3 
 
 
548 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 
551 aa  92.8  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  24.61 
 
 
462 aa  92  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 
394 aa  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  26.7 
 
 
453 aa  89.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 
403 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  27.68 
 
 
403 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 
564 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 
478 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  25.31 
 
 
483 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 
622 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  28.32 
 
 
572 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 
582 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  33.96 
 
 
555 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 
556 aa  80.9  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  27.05 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 
545 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  26 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  23.09 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  24.45 
 
 
619 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  26.41 
 
 
442 aa  77  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  26.15 
 
 
479 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  24.87 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 
402 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 
641 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 
226 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  28.63 
 
 
1492 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  29.68 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  24 
 
 
560 aa  73.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  30.18 
 
 
687 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.86 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  24.9 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  26.78 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 
663 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3059  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 
599 aa  71.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.2 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  23.51 
 
 
311 aa  69.3  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  39.18 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>