66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3059 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3059  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 599 aa  1186    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  36.64 
 
 		 589 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  33.79 
 
 		 582 aa  237  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 564 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 586 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  29.11 
 
 		 548 aa  80.1  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  23.97 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 		 545 aa  73.9  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  25.34 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  41.76 
 
 		 582 aa  72.8  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 456 aa  72  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  34.11 
 
 		 556 aa  72  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  40.43 
 
 		 555 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  25.87 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  22.66 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  24.33 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24.86 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 394 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  24.2 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  22.12 
 
 		 494 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  22.66 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  24.23 
 
 		 413 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 478 aa  56.2  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  24.13 
 
 		 423 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.58 
 
 		 469 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  23.4 
 
 		 226 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  27.27 
 
 		 456 aa  54.7  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  22.78 
 
 		 455 aa  54.3  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  22.95 
 
 		 412 aa  53.9  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 358 aa  53.5  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 402 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 545 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 448 aa  52.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 		 561 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 469 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  21.74 
 
 		 311 aa  50.8  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 462 aa  51.2  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  22.99 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  21.19 
 
 		 389 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 581 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  26.71 
 
 		 376 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  23.17 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  23.08 
 
 		 479 aa  48.1  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 620 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  22.13 
 
 		 552 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.63 
 
 		 403 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 		 403 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 235 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 641 aa  45.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 453 aa  45.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  23.8 
 
 		 663 aa  45.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 427 aa  45.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>