158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4703 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 433 aa  883    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  31.56 
 
 		 462 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 475 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 453 aa  182  8.000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  25.97 
 
 		 442 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 311 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 485 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  27.98 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  27.46 
 
 		 462 aa  136  9e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.08 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 448 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  29.92 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  28.3 
 
 		 620 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 494 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  27.86 
 
 		 548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  25.11 
 
 		 551 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  107  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  27.58 
 
 		 385 aa  104  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.6 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  26.87 
 
 		 467 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 386 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  24.17 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  25.61 
 
 		 581 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 226 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.78 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.17 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 556 aa  90.1  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  24.06 
 
 		 555 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  22.75 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 481 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  23.14 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  25.11 
 
 		 582 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  22.7 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.33 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  23.46 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  24.45 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 572 aa  76.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  35.43 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  25.87 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  34.96 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  25.2 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  23.08 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 571 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 589 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 208 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  23.6 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  22.98 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  34.21 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  24.55 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  23.79 
 
 		 582 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  23.55 
 
 		 622 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  21.41 
 
 		 543 aa  63.2  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  23.82 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  35.2 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 663 aa  63.2  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  23.7 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  27.51 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  23.92 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  23.59 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  23.82 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  26.44 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  23.33 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  21.74 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  21.01 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>