171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0329 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 455 aa  934    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 		 480 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  36.75 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  36.29 
 
 		 494 aa  233  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  28.88 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  33.52 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  28.54 
 
 		 469 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  28.5 
 
 		 382 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  25.39 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  29.12 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 468 aa  123  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  28.47 
 
 		 620 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  26.75 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 		 545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25.44 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  26.75 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  26.18 
 
 		 582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  24.55 
 
 		 462 aa  110  5e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  30.99 
 
 		 526 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 502 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  25.34 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 561 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  24.49 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 477 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 572 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  26.72 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  24.86 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  24.75 
 
 		 403 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  26.33 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  25.91 
 
 		 383 aa  104  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 403 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 509 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  26.78 
 
 		 479 aa  103  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  25.47 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.88 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  23.24 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 556 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  23.02 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  24.52 
 
 		 548 aa  98.2  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  26.58 
 
 		 545 aa  97.1  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 663 aa  96.7  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.48 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  24.6 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 299 aa  94.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  22.53 
 
 		 478 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  24.47 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 448 aa  91.3  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.39 
 
 		 389 aa  90.5  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 		 478 aa  90.5  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 		 571 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  24.79 
 
 		 555 aa  87  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  23.5 
 
 		 462 aa  87  6e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 394 aa  86.7  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 586 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.78 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  23.04 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  24.24 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  24.49 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 622 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  25.61 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 606 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  24.51 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  20.1 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  20.77 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  24.76 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  32.07 
 
 		 611 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  22.7 
 
 		 581 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  22.28 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 		 582 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>