153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3256 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  100 
 
 
545 aa  1089    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  75.05 
 
 
548 aa  835    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  37.59 
 
 
556 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  36.66 
 
 
555 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  33.39 
 
 
551 aa  252  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  33.26 
 
 
582 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 
538 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  37.92 
 
 
427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 
586 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3313  putative transcriptional regulator  50.76 
 
 
206 aa  130  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 
433 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 
448 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 
564 aa  116  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  29.18 
 
 
448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  24.34 
 
 
469 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 
469 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 
456 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 
468 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 
561 aa  107  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 
446 aa  106  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23 
 
 
455 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 
433 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 
611 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 
396 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.22 
 
 
485 aa  100  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 
471 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
386 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  26.58 
 
 
455 aa  97.1  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 
545 aa  94  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 
515 aa  93.2  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 
458 aa  92  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 
478 aa  91.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 
494 aa  91.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  24.44 
 
 
430 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 
622 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 
480 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 
480 aa  88.6  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 
479 aa  87  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 
467 aa  86.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  25.2 
 
 
581 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 
226 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  24.36 
 
 
568 aa  84  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  23 
 
 
560 aa  84  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  28.68 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 
589 aa  83.6  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 
457 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.91 
 
 
620 aa  80.9  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  27.46 
 
 
634 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  22.64 
 
 
552 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 
500 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 
383 aa  77  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 
463 aa  77  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 
481 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 
641 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 
522 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.11 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  20.43 
 
 
462 aa  75.9  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.19 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3059  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 
599 aa  73.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  22.69 
 
 
572 aa  73.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  26.76 
 
 
606 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  23.57 
 
 
582 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  23.74 
 
 
498 aa  72.8  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 
467 aa  71.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.99 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  22.67 
 
 
556 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  23.31 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  22.28 
 
 
499 aa  70.1  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 
582 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  26.41 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  25 
 
 
619 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  21.76 
 
 
554 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  22.39 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  26.23 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.41 
 
 
687 aa  67  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.62 
 
 
475 aa  67  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  25.33 
 
 
479 aa  65.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  22.04 
 
 
663 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  25.55 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 
502 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 
394 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  25.25 
 
 
311 aa  63.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  23.16 
 
 
483 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  22.34 
 
 
413 aa  62.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  24.47 
 
 
423 aa  62  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  32.37 
 
 
478 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  25.06 
 
 
484 aa  61.6  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>