73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0004 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 568 aa  1169    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  59.58 
 
 		 572 aa  721    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  40.07 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  40 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  38.88 
 
 		 556 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  39.79 
 
 		 554 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2241  putative transcriptional regulator  40.55 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  29.5 
 
 		 488 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  28.16 
 
 		 484 aa  143  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  24.63 
 
 		 483 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  28.61 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  29.39 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1286  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 219 aa  113  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.44 
 
 		 556 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  107  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  25.44 
 
 		 555 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  23.72 
 
 		 548 aa  91.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 		 545 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.24 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  22.07 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  23.26 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  22.7 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 581 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 611 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  22.27 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 628 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  22.08 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  23.37 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  27.02 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.76 
 
 		 475 aa  57  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  22.01 
 
 		 456 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  21.29 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  23.67 
 
 		 551 aa  55.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 430 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  30.8 
 
 		 479 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 469 aa  54.3  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 		 463 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  21.82 
 
 		 561 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  22.11 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.23 
 
 		 687 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  22.85 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 564 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 468 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  30.84 
 
 		 470 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  25.62 
 
 		 276 aa  51.2  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 		 412 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 472 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 		 383 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  28.05 
 
 		 456 aa  50.4  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.06 
 
 		 634 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.11 
 
 		 526 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 459 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 456 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 311 aa  48.1  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 		 459 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 663 aa  47.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 589 aa  47.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.08 
 
 		 446 aa  47  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4969  hypothetical protein  43.86 
 
 		 57 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 492 aa  43.9  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  22.82 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>