57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2241 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2241  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 441 aa  900    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  43.45 
 
 		 560 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 		 572 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  40.55 
 
 		 568 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  41.59 
 
 		 552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  41.26 
 
 		 556 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 554 aa  309  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  41.09 
 
 		 256 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  24.76 
 
 		 538 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  25.6 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23.79 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 582 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 687 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  22.41 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 581 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  24.21 
 
 		 589 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 586 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 430 aa  54.7  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 311 aa  53.1  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  21.5 
 
 		 548 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 		 564 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  34.86 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 628 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  30.97 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 611 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  29.82 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  23.16 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 456 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  32.08 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.87 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 		 504 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  23.47 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  27.31 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 		 508 aa  44.3  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  33.06 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 643 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 663 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  23.1 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 383 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  28.3 
 
 		 480 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 620 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 620 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>