125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0152 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 483 aa  998    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  49.27 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  58.58 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  42.71 
 
 		 483 aa  395  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  40.53 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  39.54 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  39.87 
 
 		 478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  41.56 
 
 		 470 aa  330  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  40.04 
 
 		 472 aa  310  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1286  putative transcriptional regulator  50.49 
 
 		 219 aa  223  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  50.95 
 
 		 207 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4293  hypothetical protein  63.45 
 
 		 153 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 568 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 572 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 485 aa  91.3  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 556 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  27.82 
 
 		 552 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2492  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 92 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  38.02 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  22.31 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  23.06 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 		 606 aa  69.7  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  24.01 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.71 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  24.8 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  24.22 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  28.43 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.1 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  22.06 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  34.19 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  25.05 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  23.57 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  24.06 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  24.21 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.72 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  32.99 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  30.63 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 581 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 456 aa  57  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  22.25 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 687 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 634 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 628 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4969  hypothetical protein  45.61 
 
 		 57 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  28.32 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 582 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  23.22 
 
 		 483 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1492 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.29 
 
 		 382 aa  53.9  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 454 aa  53.5  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  30.61 
 
 		 235 aa  53.5  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 663 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 		 383 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 502 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 560 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  20.93 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 		 619 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  21.95 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  30.63 
 
 		 548 aa  51.2  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  22.4 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 572 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 358 aa  50.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 		 394 aa  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 455 aa  50.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.72 
 
 		 582 aa  50.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  33.62 
 
 		 586 aa  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  24.02 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  25.13 
 
 		 205 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  22.78 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  35.05 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 611 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  21.25 
 
 		 545 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 		 478 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>