159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0085 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 641 aa  1305    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  50.62 
 
 		 634 aa  608  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  40.7 
 
 		 687 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 611 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  41.32 
 
 		 606 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  44.77 
 
 		 628 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  40.03 
 
 		 619 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  26.08 
 
 		 622 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  28.6 
 
 		 582 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 571 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  25.04 
 
 		 656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  25.04 
 
 		 656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  25.29 
 
 		 663 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 479 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.53 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 456 aa  127  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  28.51 
 
 		 543 aa  124  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 433 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  28.91 
 
 		 572 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  26.33 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  26.33 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  24.58 
 
 		 643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  28.51 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 396 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  30.03 
 
 		 402 aa  102  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 		 386 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 545 aa  100  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  25.3 
 
 		 548 aa  99.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 485 aa  99.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 394 aa  99  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 663 aa  93.6  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 		 394 aa  92.8  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  25.11 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 602 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  28.01 
 
 		 483 aa  88.2  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 		 561 aa  87.8  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  26.78 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  26.68 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  26.74 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  26.12 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  27.99 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  27.4 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.33 
 
 		 620 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  30.54 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  21.24 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  27.85 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  25.24 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 		 556 aa  77  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  23.31 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 545 aa  75.1  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  22.38 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  29.43 
 
 		 582 aa  72.8  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 467 aa  72  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  26.6 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 498 aa  70.5  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1492 aa  70.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 581 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.54 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  24.09 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  29.38 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  28.73 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  22.86 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  28.06 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  25.59 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  23.3 
 
 		 462 aa  62  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  23.83 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  23.24 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 538 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>