81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0048 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 656 aa  1362    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  63.24 
 
 		 663 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  99.7 
 
 		 656 aa  1361    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  41.83 
 
 		 643 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  53.85 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  38.13 
 
 		 622 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  32.66 
 
 		 543 aa  276  7e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  29 
 
 		 460 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  37.22 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  30.24 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  25.36 
 
 		 687 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.67 
 
 		 634 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  43.84 
 
 		 167 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  42.47 
 
 		 167 aa  129  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 620 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 620 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  39.46 
 
 		 167 aa  124  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0397  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 		 167 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 167 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 167 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 167 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3577  putative transcriptional regulator  40.13 
 
 		 167 aa  120  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3244  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0396  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 167 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00892545  normal  0.277026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3628  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 167 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000786438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  25.04 
 
 		 641 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0449  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 171 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  23.38 
 
 		 606 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  23.1 
 
 		 611 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  26.04 
 
 		 619 aa  94.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 582 aa  90.9  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  25.8 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 499 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  24.74 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  24.6 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 628 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  23.45 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  24.51 
 
 		 571 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  26.76 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  29.41 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  28.64 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  23.06 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  23.92 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  23.31 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 602 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  23.47 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  23.27 
 
 		 572 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  22.22 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  24.72 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  22.24 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  22.54 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.04 
 
 		 382 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.23 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 481 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 448 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 		 556 aa  55.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 		 472 aa  54.7  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  23.25 
 
 		 430 aa  54.7  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  22.85 
 
 		 469 aa  54.3  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  23.91 
 
 		 433 aa  54.3  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 479 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  23.33 
 
 		 555 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  24.35 
 
 		 548 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  21.25 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  23.38 
 
 		 374 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  23.92 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  22.66 
 
 		 334 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 		 299 aa  48.9  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  21.94 
 
 		 551 aa  48.1  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  22.56 
 
 		 586 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 484 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  24.94 
 
 		 470 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 		 581 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 226 aa  43.9  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>