28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0397 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0397  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  348  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0396  putative transcriptional regulator  98.8 
 
 		 167 aa  344  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00892545  normal  0.277026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3628  putative transcriptional regulator  97.6 
 
 		 167 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000786438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  90.42 
 
 		 167 aa  317  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  86.83 
 
 		 167 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  86.23 
 
 		 167 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  86.23 
 
 		 167 aa  307  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  86.23 
 
 		 167 aa  307  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3577  putative transcriptional regulator  85.63 
 
 		 167 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0449  putative transcriptional regulator  71.61 
 
 		 171 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  68.79 
 
 		 167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  68.15 
 
 		 167 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3244  putative transcriptional regulator  66.89 
 
 		 163 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 504 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 		 656 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 		 656 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 663 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  39.86 
 
 		 643 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  36.69 
 
 		 622 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  37.01 
 
 		 515 aa  97.8  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  36.6 
 
 		 543 aa  95.9  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 602 aa  61.6  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 620 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 620 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 582 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 572 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.7 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 458 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>