32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4303 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  351  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3628  putative transcriptional regulator  91.62 
 
 		 167 aa  320  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000786438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0396  putative transcriptional regulator  91.02 
 
 		 167 aa  320  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00892545  normal  0.277026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0397  putative transcriptional regulator  90.42 
 
 		 167 aa  317  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  83.23 
 
 		 167 aa  294  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  83.83 
 
 		 167 aa  294  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  83.23 
 
 		 167 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  83.23 
 
 		 167 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3577  putative transcriptional regulator  82.04 
 
 		 167 aa  291  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  68.15 
 
 		 167 aa  229  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  67.52 
 
 		 167 aa  227  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0449  putative transcriptional regulator  68.39 
 
 		 171 aa  226  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3244  putative transcriptional regulator  64.9 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 		 656 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 		 656 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 663 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  39.86 
 
 		 643 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  38.13 
 
 		 622 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 515 aa  100  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  35.95 
 
 		 543 aa  97.8  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 602 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 		 620 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 		 620 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  29.71 
 
 		 582 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  27.19 
 
 		 485 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 641 aa  44.7  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 572 aa  44.3  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 499 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 458 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  26.97 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 222 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>