93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2888 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 602 aa  1183    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 		 582 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 478 aa  160  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 478 aa  153  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 571 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 492 aa  135  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 515 aa  95.9  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.95 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 620 aa  91.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 620 aa  91.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 634 aa  87.4  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 448 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  31.51 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 687 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  32.01 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  34.11 
 
 		 167 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  23.85 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 622 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  33.33 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  22.86 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  22.92 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  25.99 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  22.88 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  22.65 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  27.13 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  22.01 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0449  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 171 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0397  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 167 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0396  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00892545  normal  0.277026 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  24.63 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  24.63 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  26.49 
 
 		 167 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 167 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  24.28 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 167 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 167 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  25.65 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  23.82 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  22.73 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3244  putative transcriptional regulator  24.36 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  24.44 
 
 		 628 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  22.6 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3628  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000786438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 		 167 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3577  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 		 167 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535476  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 		 454 aa  54.7  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 		 423 aa  54.7  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 		 620 aa  54.3  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 		 545 aa  53.9  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  22.42 
 
 		 391 aa  53.5  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  28.2 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  23.64 
 
 		 545 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  17.99 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  20.65 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  21.94 
 
 		 455 aa  51.2  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  24.38 
 
 		 423 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25.39 
 
 		 456 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  22.54 
 
 		 619 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  23.01 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 478 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 		 299 aa  47.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 538 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  24.3 
 
 		 483 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 423 aa  47.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  23.67 
 
 		 470 aa  47.4  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  22.31 
 
 		 457 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  23.41 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 551 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  20.92 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  21.73 
 
 		 1123 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 468 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 586 aa  44.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  22.7 
 
 		 509 aa  44.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 394 aa  44.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  22.44 
 
 		 467 aa  43.9  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 483 aa  43.9  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  24.76 
 
 		 469 aa  43.5  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>