129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0667 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  678    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  52.63 
 
 		 456 aa  345  6e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 433 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  36.22 
 
 		 448 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  35.26 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 455 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 		 446 aa  139  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 480 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  30.79 
 
 		 471 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  29.88 
 
 		 480 aa  125  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 494 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 469 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 469 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  29.96 
 
 		 383 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  25.08 
 
 		 462 aa  98.2  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 396 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 463 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 		 457 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 412 aa  92.8  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 468 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 620 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 423 aa  86.3  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  25.08 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 		 582 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.45 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 		 572 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  26.05 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.98 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.18 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  27.17 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.38 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  25.79 
 
 		 586 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.83 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 		 545 aa  75.9  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  25.46 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 522 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  25.92 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  27.07 
 
 		 526 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 571 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25.81 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 		 561 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1492 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 538 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 564 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  26.87 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  25.3 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  23.28 
 
 		 552 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3059  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 		 599 aa  63.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  20.91 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  26.06 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 556 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 483 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  21.39 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  25.29 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  25.29 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  25.57 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 602 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  26.14 
 
 		 555 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  24.32 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  24.37 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  26.91 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.8 
 
 		 556 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.32 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>