155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1892 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  778    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  84.51 
 
 
391 aa  668    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  54.26 
 
 
454 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  43.47 
 
 
402 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  42.6 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 
299 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  36.91 
 
 
396 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 
403 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  30.07 
 
 
403 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 
412 aa  155  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 
412 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 
413 aa  154  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 
480 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 
480 aa  143  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 
471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  29.24 
 
 
494 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 
455 aa  133  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 
376 aa  129  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  29.15 
 
 
423 aa  127  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  29.26 
 
 
423 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 
469 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  30 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 
448 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  28.61 
 
 
468 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 
456 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 
477 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  27.53 
 
 
620 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  29.33 
 
 
456 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 
394 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  28.61 
 
 
479 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 
448 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 
572 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 
481 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  26.59 
 
 
433 aa  93.6  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 
522 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  33.9 
 
 
526 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 
457 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  22.75 
 
 
433 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 
508 aa  87.4  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  26.59 
 
 
394 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23.71 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  26.22 
 
 
462 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 
463 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 
502 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  23.57 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  26.1 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.95 
 
 
475 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 
561 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 
582 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  26.02 
 
 
538 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 
459 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 
334 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  31.76 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 
484 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  23.65 
 
 
467 aa  77  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  35.4 
 
 
207 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 
500 aa  77  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 
462 aa  76.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25.29 
 
 
462 aa  76.6  0.0000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  23.01 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 
571 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.86 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  23.36 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  23.77 
 
 
492 aa  72.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.57 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.89 
 
 
687 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  23.46 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  25.98 
 
 
479 aa  67  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  23.87 
 
 
472 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 
235 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 
383 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  32.11 
 
 
241 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  32.59 
 
 
208 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 
519 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  23.77 
 
 
458 aa  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 
358 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 
509 aa  63.2  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  26.58 
 
 
1492 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1275  putative transcriptional regulator  64 
 
 
124 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  21.76 
 
 
1123 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  23.85 
 
 
556 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 
226 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 
498 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  24.87 
 
 
548 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 
138 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25 
 
 
634 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 
223 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>