81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1712 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  271  3e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 		 433 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  34.35 
 
 		 455 aa  75.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 430 aa  68.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  27.86 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  30.37 
 
 		 382 aa  60.1  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  28.57 
 
 		 377 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 456 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 485 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 448 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 385 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 471 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  34.11 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 494 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 446 aa  55.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 334 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0527  hypothetical protein  31.3 
 
 		 429 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.81 
 
 		 442 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 		 396 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 455 aa  50.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 480 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 545 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 402 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 		 498 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  31.01 
 
 		 480 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 402 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0830  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 		 478 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.702449 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 		 403 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  37.17 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  30.66 
 
 		 403 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 484 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 469 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  30.47 
 
 		 199 aa  47.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  26.15 
 
 		 356 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 433 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 478 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  48.94 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 469 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 389 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 556 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 538 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 386 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 222 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 545 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  31.86 
 
 		 555 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 481 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 475 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 551 aa  44.3  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  41.38 
 
 		 277 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 632 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 230 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  30.84 
 
 		 548 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 313 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  44.68 
 
 		 360 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  28.83 
 
 		 412 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  32.93 
 
 		 422 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  24.64 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 412 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 		 477 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 394 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  41.18 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1088  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 346 aa  41.2  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41484  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2047  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  32.61 
 
 		 582 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 376 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4944  hypothetical protein  27.81 
 
 		 299 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 412 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1340  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 		 519 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  28.1 
 
 		 456 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3980  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00414076  normal  0.398554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2059  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 390 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 463 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 462 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1016  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 396 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3019  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>