10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1340 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1340  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 519 aa  1052    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0008  divergent AAA region  33.73 
 
 		 412 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3426  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1088  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 346 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1111  ATP-binding protein, putative  25 
 
 		 359 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4025  hypothetical protein  42.67 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0085  hypothetical protein  40 
 
 		 396 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2084  divergent AAA region  38.46 
 
 		 135 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.497784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3226  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 208 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>