94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2295 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  420  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  38.83 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 230 aa  101  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  34.6 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3980  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00414076  normal  0.398554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  35.43 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 455 aa  71.2  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 433 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 402 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 		 396 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  34.11 
 
 		 377 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  32.59 
 
 		 382 aa  64.7  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  33.06 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 620 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 430 aa  61.6  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 471 aa  62  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 480 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 480 aa  61.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.36 
 
 		 485 aa  61.2  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 467 aa  58.2  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 484 aa  58.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  28.91 
 
 		 412 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 		 467 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 463 aa  55.1  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  29.79 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  31.91 
 
 		 356 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 403 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  28.12 
 
 		 403 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  29.59 
 
 		 770 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 374 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 494 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 632 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  30.65 
 
 		 548 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 		 498 aa  52.4  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  45.76 
 
 		 448 aa  52  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  28.16 
 
 		 555 aa  52  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  37.08 
 
 		 469 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  29.46 
 
 		 483 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 499 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  23 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  27.78 
 
 		 382 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  37.17 
 
 		 138 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 		 545 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 385 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 561 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 389 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4294  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 		 300 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0527  hypothetical protein  25.93 
 
 		 429 aa  48.5  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 489 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 556 aa  48.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 481 aa  48.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 		 458 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2380  hypothetical protein  53.85 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 1687 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2011  putative transcriptional regulator  53.85 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 545 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  30.38 
 
 		 348 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 1672 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  32.11 
 
 		 468 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2925  divergent AAA-4 ATPase related protein  29.55 
 
 		 407 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  35.8 
 
 		 277 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 423 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 663 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_002936  DET1111  ATP-binding protein, putative  36.99 
 
 		 359 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 456 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0830  putative transcriptional regulator  24.6 
 
 		 478 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.702449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1340  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 519 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.56 
 
 		 456 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  26.17 
 
 		 705 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6893  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  24.55 
 
 		 485 aa  42.4  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  36.07 
 
 		 778 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  28.8 
 
 		 475 aa  42  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  32.2 
 
 		 777 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 455 aa  41.6  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 551 aa  41.6  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  38.04 
 
 		 470 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 433 aa  41.6  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>