13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4025 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_4025  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  806    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0085  hypothetical protein  76.15 
 
 		 396 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3226  hypothetical protein  62.54 
 
 		 327 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3193  hypothetical protein  47.4 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0244949  hitchhiker  0.00323377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0011  hypothetical protein  47.65 
 
 		 326 aa  298  9e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2401  hypothetical protein  38.91 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3755  hypothetical protein  31.56 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0094  hypothetical protein  28 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1271  hypothetical protein  43.18 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1475  hypothetical protein  29.55 
 
 		 359 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000081449  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1585  hypothetical protein  28.37 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1340  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00260  hypothetical protein  26.21 
 
 		 290 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>