13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1088 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1088  putative transcriptional regulator  100 
 
 
346 aa  694    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1111  ATP-binding protein, putative  38.11 
 
 
359 aa  242  7e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3426  putative transcriptional regulator  43.91 
 
 
438 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1340  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 
519 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0008  divergent AAA region  31.72 
 
 
412 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3019  putative transcriptional regulator  46.55 
 
 
65 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 
374 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2084  divergent AAA region  28.92 
 
 
135 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.497784  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 
469 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 
483 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 
471 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>