12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3226 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3226  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  668    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4025  hypothetical protein  62.54 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0085  hypothetical protein  57.01 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3193  hypothetical protein  40.74 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0244949  hitchhiker  0.00323377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0011  hypothetical protein  39.75 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2401  hypothetical protein  40.17 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0094  hypothetical protein  30.31 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1475  hypothetical protein  32.85 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000081449  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3755  hypothetical protein  30.8 
 
 		 427 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1585  hypothetical protein  30.77 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1340  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1271  hypothetical protein  29.73 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>