13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1111 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1111  ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 359 aa  733    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1088  putative transcriptional regulator  38.11 
 
 		 346 aa  242  7e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3426  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1340  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 519 aa  86.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0008  divergent AAA region  29.8 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2084  divergent AAA region  34.09 
 
 		 135 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.497784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  27.34 
 
 		 479 aa  46.2  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  31.52 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 208 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 538 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 423 aa  43.1  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>