136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0799 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  100 
 
 
374 aa  759    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  46.42 
 
 
389 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  37.97 
 
 
377 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  37.97 
 
 
377 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
471 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 
386 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 
480 aa  122  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 
485 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 
455 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 
494 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  24.21 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1824  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 
304 aa  90.1  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 
620 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  24.92 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 
492 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 
456 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 
468 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.57 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  25.13 
 
 
555 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 
571 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  24.27 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  24.24 
 
 
572 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  24.51 
 
 
469 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 
545 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  23.06 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  24.76 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  23.24 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  22.79 
 
 
634 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.41 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  24.39 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  23.59 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  23.37 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  23.61 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  23.61 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  25.98 
 
 
611 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  24.09 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 
479 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  23.89 
 
 
479 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  23.37 
 
 
478 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  22.51 
 
 
606 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 
519 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 
430 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 
502 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 
663 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  21.82 
 
 
515 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4294  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 
300 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 
462 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0712  putative transcriptional regulator  30.52 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.852525  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 
508 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  23.06 
 
 
448 aa  63.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5429  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 
622 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  21.22 
 
 
582 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  25.63 
 
 
687 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.02 
 
 
526 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  21.39 
 
 
457 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  24.49 
 
 
469 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.35 
 
 
561 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 
522 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  22.51 
 
 
467 aa  59.7  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  23.49 
 
 
483 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  23.64 
 
 
433 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  21.92 
 
 
568 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2925  divergent AAA-4 ATPase related protein  25.95 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  23.47 
 
 
456 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  21.05 
 
 
545 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  22.66 
 
 
484 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  22.68 
 
 
504 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 
218 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  22.85 
 
 
446 aa  56.6  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  21.98 
 
 
572 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  22.45 
 
 
459 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  24.67 
 
 
551 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 
222 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  23.03 
 
 
554 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 
663 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00285  hypothetical protein  30.34 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.464605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 
223 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 
208 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 
241 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  21.41 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.73 
 
 
475 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 
485 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 
628 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  21.28 
 
 
478 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  22.35 
 
 
560 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2864  transcriptional regulator  34.15 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  23.45 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1088  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>